疫区不断扩大，重灾区已被官府隔离，李时珍冒死在重灾区救治百姓，得知斯语也来到疫区，便来到临时用来隔离疫区的护城河边与斯语隔河相会。官府规定隔离区一律只进不出，疫区尚未染病的灾民想逃出疫区被官兵射杀无数。李时珍为安抚百姓，当众饮用被污染的河水，说自己也染病毒，大限只有七天，要百姓相信他七天定能治好染病的百姓。暴乱平息。李时珍吩咐斯语和金基泰，能治好瘟疫的药方尚缺灵芝，让他们无论如何要在七天之内找回灵芝。

《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十七集

　　斯语和金基泰奔走深山，惊奇地发现本是盛产灵芝的地方却找不见灵芝，一位采药老农告诉他们灵芝已被朝廷征收。二人赶紧抄近路追赶朝廷征收灵芝的车队，斯语从山上摔下来被苌葶率领的车队相救，苌葶得知李时珍尚在疫区，火速赶来。李时珍此时已感染了疫情，情形危急。苌葶做主将御药灵芝全捐献给了疫区。斯语和金基泰说动官员进入隔离区，李时珍和百姓得救，疫情也得到了控制。

　　有人告李时珍动用御药，罪当杀头，可是皇上念李时珍除疫有功，提拔为太医院吏目，赏白银百两药材百斗。李时珍和家人团聚，在李时珍帮助下，黄一丰和玉兰开起了药膳馆，生意红火。

《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十八集

　　严世蕃找到景王，拿出一摞戚继光抗倭的捷报劝说其赴前方督战，景王心生畏惧，不愿冒险。严世蕃说景王只要有了战功，朝廷上下当刮目相看，立太子就顺理成章，若怕瘟疫，就让李时珍同行。景王答应，于是向嘉靖请求去前线督战。嘉靖十分欣慰。李时珍到景王府与景王商议修本草一事，景王便采取激将法使李时珍同意随自己出征。李时珍答应跟随景王让裕王高拱等人大为反感。

　　景王要演一出与战士同甘苦，共患难的闹剧，又担心吃不惯士卒吃的伙食，便命徐管家做一批吃肉不见肉的食品随身携带。徐管家和景王府的厨师们如热锅上的蚂蚁。热心的黄一丰决定帮徐管家一把，几经试验，黄一丰和玉兰终于发明了一种美味的饼干。黄一丰要李时珍品赏自己的杰作，并告诉是徐管家所托为景王特制，当即招来李时珍一顿责骂，他坚持认为景王不是那种贪图享乐之人。

《大明医圣李时珍》分集介绍： 第二十九集

　　李时珍在渐江前线见景王慷慨陈词，暗暗庆幸自己遇到了明主。一天，李时珍在营帐内为一位受伤的旗兵治伤，得知戚继光精心设计的一场破敌战术，竟让胆怯的景王给搅了，戚家军损失惨重。李时珍大为疑惑。当晚，又从景王随从徐管家处得知景王的确没有和将士们同甘共苦，而是只吃黄一丰为他特制的饼干，还听到景王要管家去贿赂戚继光帮忙掩盖他在战场上“丑事”，李时珍失望之极。戚家军最后组织夜间偷袭成功，大胜敌寇，景王班师回朝后受到皇上封赏。

　　景王府办起庆功宴，李时珍心灰意冷，拒绝与景王、严世蕃之流喝酒，不欢而散。李时珍来到十珍斋见黄一丰与徐管家等人结拜兄弟，并劝李时珍入伙。李时珍一气之下，掀翻了桌子，不顾黄一丰的求情赶走了徐管家等人。黄一丰生气，要与李时珍绝交。

《大明医圣李时珍》分集介绍： 第三十集