陈安瘫软在廖云山面前，他交代出此行任务是协助303做争取储汉君北上的工作，但对303的情况一无所知。廖云山笑着把陈安未交代的关系一一点破：陈家与储家是世交，陈家曾经有恩于储家，储汉君的小女儿储兰云是两家指腹为婚许配给陈安的妻子。储汉君的妻子刚病故，他是以吊唁的为名前往的。廖云山让陈安放弃幻想，只有配合他们抓到303，陈安才有活路。之后肖鹏从陈安箱子的夹层里搜出了陈安携带的、要交给303的绝密文件，这是从国民党内部影印出来的绝密文件，明确指令在共产党召开新政协会议之前，如对储汉君等民主党派领袖争取不成，便暗杀之。陈安对自己的处境深感绝望，为了苟且偷生，他同意配合廖云山抓捕303。陈安隐瞒了另一个要争取的人物徐杰生，为的是给自己留条后路。肖鹏向陈安追查阿冬的任务，陈安也提供不出更多的东西。肖鹏总感觉不踏实，丁副官却嘲笑肖鹏庸人自扰。盯着陈安，肖鹏一言不发，突然下令搜查阿冬的休息室。搜查一无所获。

　　独自坐在包厢内的廖云山看着手中的那份密令，告诉肖鹏，储汉君是当今国内最知名的法学家，民生党主席，是在国共之间保持中立的第三势力的代表人物，也是国共双方都极力争取的关键人物。如今离中共召开新政协会议只有99天，这个人，无论如何不能让共产党带走。

　　天亮了，肖昆突然布置贾程程去密室等待接报，明确告诉贾程程，火车到达上海之前一小时收不到接站电报，将取消接头。显然，事先肖昆并没把这个秘密指令告诉贾程程。贾程程虽然对肖昆严密的筹算很佩服。

　　贾程程刚从店里出去，紧急搜捕开始了。军用车急煞在刚开张的各家店铺门前，王双全慌里慌张地跑进来通报消息。千钧一发之时，何三顺出现了，他带来了徐杰生签发的特别通行证，肖昆的判断是正确的。

　　火车上，肖鹏布置车站抓捕303的各种细节，按照肖鹏的布置，一辆临时加车没按时到站，车站上的候车人上不了车，一时人声鼎沸，乱哄哄嚷成一团。特务们夹杂在人群里，等待从武汉来的火车进站。

　　贾程程坐在电台前专注等待着，拿到特别通行证的肖昆赶到，见仍然没有任何消息，肖昆的眉头皱起来。

　　火车上，一时一刻没有放弃思索的肖鹏从阿冬腰带里搜出行李车钥匙，终于在行李车找到了阿冬藏匿的发报机。肖鹏马上把陈安押到发报机前，就在肖昆准备放弃接报的时候，贾程程收到了陈安发射的电波……

　　陈安放下发报耳机，肖鹏冷静地威胁陈安，如果跟303接不上头，你会死得很惨。

　　肖昆和贾程程马上去车站发货并同时接人，货发的很顺利，陈安所乘的列车也如期进站。看着列车缓缓进站，看着站台上乱哄哄的人群，肖昆突然有了种不详预感。他正紧张地思索，纷乱的人群里，贾程程却一眼看见手拿接头暗号的陈安从车厢走下来，没待肖昆阻止，贾程程已快步向陈安走去……

《最后的99天》分集情介绍：第二集

　　肖昆赶紧追上贾程程，几乎与此同时，肖昆看见车厢里正盯着贾程程往前走的弟弟肖鹏。肖昆大吃一惊，兄弟俩分别三年，肖昆不知道肖鹏已经回国。长期从事地下工作，磨砺出肖昆机敏谨慎的行事原则，这个意外的一瞥让他本能地预感不好，因为他知道弟弟是干什么的，肖鹏这时的突然出现不能不让肖昆起疑。阻拦贾程程已经来不及，因为他清晰地看见肖鹏在车厢里正一步步跟着向陈安走去的贾程程。在万分危急的关头，他冲车厢里大喊肖鹏，肖鹏一愣，看见车厢外正向他挥手冲来的肖昆。周围没有防备的特务顿时紧张起来，而这一切没有逃过贾程程的眼睛，差点就跟陈安打招呼的贾程程惊出一身冷汗，她赶紧转向肖昆。眼看着就走到面前的贾程程突然回身看奔向车厢的肖昆，陈安非常失望，他转身走了。