双方开火，友煌趁一片混乱潜近炮台，飞龙也带飞虎逃来此处。飞虎不领飞龙的情，飞龙怪飞虎置自家兄弟生死、百姓安危于不顾。

《飞龙在天》分集剧情：第37集

　　友煌登上炮台，装置好炸药，欲点燃。飞虎向前阻止，一掌将友煌击落海中，飞龙见状和飞虎大打出手，飞虎制止未果，炮台炸毁。台湾在军民合作之下击退法军，民兵团一行人回到艋甲受到热烈的欢迎，但万里、飞龙等人的心情确是沉重的，尤其是明秀。黄母、艳秋和惠娘也在人群之中，惠娘见飞龙无恙，碍于身份不便相认。

　　民兵团和飞虎所率领的军队狭路相逢。飞虎因暗中和法人议和的消息传艋甲，被人怀疑通敌卖国而受到大家的唾弃。永来斥飞虎沉不住气，谈和之事乃朝廷密旨，岂可公然谈论？飞虎不服，当初受旨办事，现在却成了卖国贼。永来表示不必心急，武馆的荣耀是暂时的，他会帮飞虎扳回一成，让大家知道真正通敌卖国的是武馆。飞虎出，黄母寻来，黄母伤心，为何大家都说飞虎卖国？路人向飞虎丢菜辱骂，黄母挺身挡，飞虎气极，将丢菜百姓赶走。黄母忧心飞虎未来，飞虎也感到沮丧。

　　万里作主将友煌牌位供于祠堂，交待择日将友煌衣物葬于衣冠坟，明秀哭倒。飞龙内疚未能保护友煌，天九起哄，都是李禄有心害民兵团送死，给了一批破铜烂铁，才连累友煌赴死。杜直自责自己运军火回来时太疏忽。

　　逢春、玉树将玉红揪回家，逢春气坏了，害他白白买了医药送给民兵团，更担心玉红有没有失节？玉红话带玄机，让逢春误以为玉红已经失节给飞龙了。逢春急交待玉树速办婚事，玉红惊喜。

　　刘铭传询问永来部份军火的下落，永来故意做出为难状，表示法军投降前一晚有一批军火移交民兵团，战胜后未交回，因为民兵团为台湾立功，不方便明办，只能暗查。刘铭传送“功在艋甲”匾额给武馆，众乡亲道贺，黄母也在其中沾光，飞虎躲在人群中，心有戚戚焉。

《飞龙在天》分集剧情：第38集

　　万里发表感言：功劳全在友煌身上，可惜友煌为国捐躯，明秀文言，痛不欲生。逢春假意来到贺，重提飞龙、玉红婚事，万里当下承诺婚事，飞龙心情沉重，却见明秀迳自往武馆走去。明秀举刀欲随友煌去，飞龙这时救下时秀，斥责明秀糊涂。明秀情绪激动，求死心坚决。明秀和飞龙争吵，引来天九、杜直。飞龙来找飞虎，欲带他回武馆祭祀友煌，飞虎不肯。飞龙表示他愿意帮飞虎掩饰他杀友煌的真相，但飞虎必须向友煌上香，飞虎依旧不从，两人大打出手。艳秋、惠娘闻声来，李禄亦在旁观看，艳秋要李禄伸援手，李禄藉口这是兄弟家务事，不便插手。飞龙以腰带捆绑飞虎双手，拉走飞虎。飞龙拉着飞虎走在街上，路人头以异样的眼光，辱骂飞虎是卖国贼。飞龙带飞虎到祠堂，要他向友煌的灵位磕头赔罪，飞虎仍辩称自己对得起朝廷，何罪之有？

《飞龙在天》分集剧情：第39集

　　明秀呆坐在友煌坟前，李禄来，告知友煌是飞虎害死的。玉红藉口要明秀陪她办嫁妆，其实是要拉明秀外出散心。路上遇到飞虎，明秀上前和他理论，欲为友煌讨回公道，两人大打出手。飞虎抓走明秀，痛打她一顿，将对武馆的恨意加诸在她身上。惠娘来劝，飞虎斥这是忠义堂的事，她管不着。飞龙求见，飞虎告知不见，李禄却来放行。飞龙率天九、杜直入，亟欲找明秀。飞虎带出受私刑拷打的明秀，飞龙心疼。飞龙欲带明秀走，飞虎不肯，双方大打出手，明秀趁隙持刀刺伤飞虎手臂，与飞龙等人赶紧逃走。飞龙带明秀躲在废墟，明秀悲伤未能帮友煌报仇，哭倒在飞龙怀中，玉红来，见状，心有戚戚焉。玉红带来粮食，并告知二人，武馆已被飞虎带人包围。

《飞龙在天》分集剧情：第40集

　　明秀决定要逃往他乡。飞虎询问明秀下落，飞龙为让明秀脱离魔掌，装做不知道，从此众人不知明秀下落，明秀孤独却自由。飞虎再次向玉红表明心意，玉红断然拒绝接受飞虎，并以死明志，愿一生一世与飞龙相守，飞虎虽有怨恨却万般无奈，只能愤然退出单恋的三角情。

　　飞龙历尽艰辛，努力出人头地，在家人及忠义堂众人的祝福下前去迎娶玉红，万里满心安慰；玉红欢天喜地的在房中等待飞龙前来迎娶，艳秋羡慕玉红能跟心爱的人结婚，玉红安慰。玉红父亲虽不愿玉红嫁给飞龙，但玉红的坚持让他只能无奈的在大门将女儿送出，祝福女儿幸福。飞龙在一片热闹喜气下终于让玉红上了花轿，开创两人新的人生！