此时，在国军高层中开展统战工作的八路军少将从戎突然失踪，边国烈令巩向光调查此案。巩向光抓到了真凶，并巧妙地将证据提供给地下党，使蒋介石的阴谋公之于众。事后，巩向光又向秦剑提出重新入党的要求，结果又使他陷入深深的痛苦之中。

　　军统对渭城地下党情报工作的威胁日益严重，巩向光一次次冒着危险使地下党化险为夷。鉴于巩向光的特殊贡献，地下党同意安排他赴延安一诉隐情，以便回到党的怀抱。就在欣喜之际，边区形势骤变，延安之行只得搁浅，巩向光又一次承受着命运对他的捉弄。但他在此期间，仍然清除了隐藏在地下党中的内奸，并协助地下党完成了一项又一项任务。

　　不久，最了解、信任巩向光的秦剑不幸被捕牺牲。巩向光洗刷不白之冤和回归组织的希望变得十分渺茫。在近乎绝望之中，他凭借着对信仰的坚定信念和执着追求又一次坚强地挺了过来。

　　巩向光在渭城的所作所为一直受到中统头子余沁斋的监视，同时以受到中统内部及军统特务的怀疑。在余沁斋秘密试探他未果之后，渭城军统头目严锟的密报却把他送进了重庆监狱。就在蒋介石下处决令的前夕，欧阳荷的全力营救使他得以重生。

　　回到渭城后，巩向光离开了中统系统，成为边国烈手下的一名参谋。他不顾个人安危，机智地将胡宗南、边国烈进攻延安的军事行动计划，传送到延安，为保卫党中央立下功勋。

　　渭城解放前夕，他又利用敌人内部矛盾巧妙地获取了全部特务潜伏名单和破坏行动计划，挫败了特务们逃离前破坏渭城重要设施和潜伏破坏的阴谋。

　　巩向光的情况反映到延安后，经中央调查和批准，终于使他实现了多年的夙愿，重新回到党的怀抱。

　　本片将个人命运与民族解放斗争结合在一起，将悲欢离合、忍辱负重的个人情感与矢志不渝、顽强执着的信仰追求交织在一起，呈现给人们一个情节紧张、悬念丛生、波澜壮阔、引人入胜的动人故事，为人们讲述了一个中共地下党人的特殊人生，展示了一颗伟大灵魂的心路历程。

电视剧《特殊使命》分集剧情介绍：

《特殊使命》分集介绍：第一集

　　北平。叛徒黄某在保镖护卫下乘小车回家，途中突遭一位老翁枪击，黄某和保镖倒在血泊中。巡警闻声赶到时，老翁已机智逃离。这老翁就是北平地下党的年轻党员巩渭平。

　　巩渭平的同学和恋人王琴将赴渭城探望病中父亲。巩渭平前去送别，两人依依不舍、海誓山盟。临别时，巩渭平委托王琴顺道去看望自己守寡在家的母亲。王琴走后，巩渭平的同学和上级秦剑告诉巩渭平，自己受上级委派将前往上海开展地下工作，今后巩渭平的将变为远明。